高效广谱杀虫微生物株系筛选与定向改良，国家重点研发计划（2017YFD0201201），2017.07-2020.12,222.50万，主持。

苏云金芽胞杆菌sRNA的多样性分析和功能研究，国家自然科学基金(31670085)，2017-2020，62万元, 主持。

高效新型微生物资源引进与创新，农业部948 重点项目(2016-X21)，2016-2017，100万元，主持。

高效新型微生物资源引进与创新，农业部948 重点项目(2011-G25)，2011-2015，其中2011年到帐150万元，2012年批准120万元，主持。

细菌类生物杀虫剂研究和产品创制，国家863计划(2011AA10A203), 2011-2015，1090万元，主持。

农业部科研杰出人才项目，农业部科研杰出人才项目，2011-2015，100万元, 主持。

苏云金芽胞杆菌晶胞粘连必须基因簇scaABCDE在将伴胞晶体定位于芽胞外壁内侧所起的作用，国家自然科学基金(编号：31270137)，2013-2016，88万元, 主持。

苏云金芽胞杆菌杀虫晶体蛋白Cry5Ba表达沉默的负调控因子及其调控模式，国家自然科学基金(31170047)2012-2015，62万元, 主持。

苏云金芽胞杆菌杀虫基因的结构功能与代谢调控研究(子课题)，国家973计划(2009CB118902), 2009-2013，166万元，主持。

苏云金芽胞杆菌杀线虫晶体蛋白对大豆胞囊线虫的杀虫攻效及其转基因大豆抗虫育种价值验证，国家转基因重大专项：2009ZX08009-032B，2009.6-2010.12，延期至2011.12月，223万元，主持。

细菌、真菌类生物杀虫剂研究和创制（子课题），国家863计划, 2006-2010，63万元，主持。

Bt高优菌株筛选及产业化开发技术的引进，国家林业局948(2006-4-41)，2006-2010，25万元。

苏云金芽胞杆菌中晶胞粘连的形成模式，国家自然科学基金（30870066）2009-2011，35万元, 主持。

苏云金芽胞杆菌Zwittermicin A的生物合成调控研究, 国家自然科学基金（30770020）, 2008-2010, 30万元, 主持。

苏云金芽胞杆菌抗病杀虫功能基因的研究与开发, 武汉市学科带头人计划（200750730311）, 2006-2009, 10万元, 主持。

农业微生物杀虫防病功能基因的发掘和分子机理研究（子课题）, 国家973计划（2003CB114201），190万元，2006-2008，主持。

苏云金芽胞杆菌杀虫抗病新基因发掘与利用技术国家863计划（2006AA02Z174）, 300万元, 2006-2008，主持。

防治植物土传病害的芽胞杆菌制剂的研究与产业化开发, 湖北省攻关（2006AA205A01）, 2006-2008, 18.9万元, 主持。

高效杀虫Bt工程菌的研究和应用, 国家863计划（2004AA214092），2004-2005，45万元。

高效杀虫Bt工程菌的研究和应用, 国家十五863计划（2001AA214011），2001-2003，30万元。

苏云金芽胞杆菌伴胞晶体与芽胞杆菌粘连的表达机制, 国家自然科学基金（30470026）, 2005-2007，25万元，主持。

苏云金芽胞杆菌抗植物病蛋白的活性和分布多样性, 国家自然科学基金（30270053）, 2003-2005，18万元，主持。

新型苏云金芽胞杆菌抗植物病害蛋白的研究, 教育部重点项目（1123）, 2001-2003，20万，主持。

利用芽胞杆菌S层蛋白构建细胞表面展示系统, 国家自然科学基金（30080013），2001-2003。

《教育部跨世优秀人才培养计划》基金, 《教育部跨世优秀人才培养计划》基金｛教育部（教技函［2001］3号）｝, 2000-2003，30万元，主持。

纸浆漂白和废水处理的技术和应用, 十五国家863计划课题（2001AA214161）, 2001-2003。

对作物根结线虫有毒苏云金杆菌基因的分离与克隆, 国家转基因专项（J00-A-003）, 2000-2002，50万元，主持。

苏云金芽胞杆菌细胞表面S-层与伴胞晶体的共存关系, 国家自然科学基金（39870036）, 1998-2001，14万元，主持。

Isolation of the crystal protein gene against plasmodia form Bacillus thuringi- ensis, 国际基金（IFS）（F/2635-2）, 1999-2001. 1.2万美元。

Study on crystal protein genes active to plant-parasitic nematodes from Bacillus thuringiensis. 国际基金（IFS）（F/2635-2）, 1997-1998. 1.1万美元。